Het bestuur van de VNR wordt gevormd door het dagelijks bestuur en de voorzitters en vice voorzitters van de taakgroepen. Het bestuur vergadert vier keer per jaar.
De samenstelling van het bestuur is als volgt:

Nelly Kalfs
Voorzitter VNR, burgemeester gemeente Lingewaard

Remco van de Ven
Secretaris en penningmeester

Ans Mol
Voorzitter Rijn/Waal, Wethouder gemeente West Maas en Waal

Vacature
Vice voorzitter taakgroep Rijn/Waal

Erik Faber
Voorzitter taakgroep IJssel, wethouder gemeente Kampen

Sjoerd Wannet
Vice voorzitter taakgroep IJssel, wethouder gemeente Zutphen

Marij Pollux
Voorzitter taakgroep Maas, wethouder gemeente Venlo

Dolf Warris
Vice voorzitter taakgroep Maas, wethouder gemeente Oss

Edmee van der Hoeven
Ambtelijk secretaris